課程資訊
課程名稱
系統微生物學
Systems Microbiology 
開課學期
108-2 
授課對象
生命科學院  生化科技研究所  
授課教師
薛雁冰 
課號
BST5049 
課程識別碼
B22 U0530 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期二3,4(10:20~12:10) 
上課地點
農化一第六 
備註
碩士班A群組必修10學分課程之一。與黃慶璨、林晉玄、吳承
總人數上限:40人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1082BST5049_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
本課程尚未建立核心能力關連
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程為微生物學進階課程,目的為以系統研究的方式(體學; -omics)
來呈現微生物的生理代謝或與外界環境及其他生物的相互關係,讓學
生可以藉此瞭解微生物學跨領域的應用與發展趨勢,以及對其他科學
領域的重要性。本課程導入基因體學、轉錄體學、蛋白質體學、代謝
體學及合成生物學等學科知識與工具,可以使學生全面性瞭微生物與
環境互動的分子機制與模型。 

課程目標
待補 
課程要求
修課資格:限本系學士班高年級以上學生
先修課程:微生物學(含實驗) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
參考書目:
The conceptual foundations of systems biology: an introduction, Marcum, Nova Science, 2009
Systems biology and synthetic biology, Fu & Panke, John Wiley & Sons, 2009
Systems biology: functional strategies of living organisms, Konieczny et. al, Springer, 2014
內容以上課講義為主。 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
3/10  Course introduction: What is systems microbiology/ Microbiota and environments/ Sequencing technology 
第2週
3/17  Evolution and Phylogenetic analyses 
第3週
3/24  Concepts and Principles in Bioinformatics/ Genome sequencing 
第4週
3/31  Microbial genomics and evolutionary implications I: Bacteria 
第5週
4/7  Microbial genomics and evolutionary implications II : Fungi  
第6週
4/14  Systems biology in host-microbe interaction 
第7週
4/21  Synthetic biology-Fundamentals and concepts 
第8週
4/28  Synthetic biology-Pathway and metabolic engineering 
第9週
5/5  Synthetic biology and applications 
第10週
5/12  Proteomics and expression tools  
第11週
5/19  Metaproteomics of microbiome 
第12週
5/26  Microbial Metabolomics and its applications 
第13週
6/2  Transcriptomics-Omics in drug resistance I 
第14週
6/09  Transcriptomics-Omics in drug resistance II 
第15週
6/16  Transcriptomics- Omics in biofilms 
第16週
6/23  Final Exam